环境污染是盘式干燥机的一个比较严重的问题。河流常被作为冷却循环水，造成生物体碎渣进到盘式干燥机与工程建筑层，减少导热系数。另一个普遍的问题是限度，它是由冲积物的化合物。
环境污染产生时，液体通换热器，和残渣的液体沉积到管的表层。沉积这种颜色可造成：
盘式干燥机的经常应用；
经常性清理盘式干燥机；
减少液体的速率越过换热器；
在盘式干燥机的规格；
环境污染减少了热应迁移的横截面积和造成的摩擦阻力提升，在盘式干燥机的热迁移。这是由于污渍层传热系数低。这减少总体导热系数和换热器高效率。这相反，很有可能会致使在抽和维护保养成本上升。